锰是作物必须的微量元素之一，植物体的正常含锰量一般为20-100毫克/公斤，因作物种类和生长条件不同而有所差异。缺锰会造成植物生长受阻，甚至停止生长，这是因为锰与植物光合作用关系极为密切，并影响生长素的代谢，对锰肥有良好反应的农作物很多。
一般作物缺锰症状表现为新生叶片脉间失绿黄化，严重时褪绿部分呈黄褐色或赤褐色斑点，逐渐增多扩大并散布于整个叶片。有时叶片发皱、卷曲甚至凋萎。大小麦缺锰早期出现灰白色浸润状斑点，新叶叶片脉间褪绿黄化，叶脉仍保持绿色，随后黄化部分逐渐变褐坏死，形成与叶脉平行的长短不一的线状褐色斑点，叶片变薄、柔软萎蔫，即褐线萎黄病。双子叶植物如棉花、油菜缺锰，幼叶首先失绿，叶脉间呈灰黄或灰红色，显示出明显的网状脉纹，有时叶片还出现淡紫色或浅棕色斑点。豆类作物如菜豆、蚕豆和豌豆缺锰，常出现种子小而开裂、畸形，并有褐色斑点，即湿斑病。种子出苗后子叶中心组织及幼茎、幼根变褐。甜菜缺锰，生育初期表现为叶片直立，叶片呈三角形，脉间有黄化斑点，称为黄斑病。继而黄褐色斑点坏死，逐渐遍及全叶，叶缘向上卷缩，严重坏死部分脱落穿孔。马铃薯缺锰，叶脉间失绿因品种不同可呈现浅绿色、黄色和红色，严重时脉间全部变为白色。柑橘类缺锰，幼叶为淡绿色并呈现细小网纹，随叶片老化而网纹变为深绿色，而脉间为浅绿色，在主脉及侧脉附近出现不规则的深色条带，严重时，叶脉间呈现许多不透明的白色斑点，使叶片呈灰色或灰白色，继而部分病斑枯死，大部分细小枝条死亡。苹果缺锰，叶脉间失绿变浅绿色，兼有斑点，从叶缘向中脉发展。严重时，脉间变褐色坏死，叶片全部为黄色，失绿遍及全树。
常用的锰肥有硫酸锰、氯化锰和硝酸锰等，生产上常用的是水溶性的硫酸锰，可用作基肥、浸种、拌种及追肥。由于作物缺锰主要发生在生育早期而影响生长，故锰肥*好在作物生长前期施用。施用硫酸锰做基肥时*好与生理酸性肥料配合施用，以防锰肥在土壤中被固定而失去肥效。由于锰容易氧化等造成利用率下降，生产中*好选用螯合态锰肥进行叶面施肥，提高锰肥的施用效果。