高分辨率熔解曲线分析(high resolution melting analysis,HRM)是国际上发展的一种新型的检测单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及扫描突变的新技术。HRM 无需使用序列特异性探针,而是利用一种饱和染料对 PCR 反应产物进行分析。
HRM技术因操作简便快捷、成本低廉、结果准确,并且实现了真正的闭管操作而受到普遍关注。
HRM原理:
在PCR反应前将新型DNA饱和荧光染料加入反应体系,然后将PCR产物直接导入高分辨熔解分析仪中,在一定的温度范围内将PCR扩增产物进行加热变性,仪器的光学检测系统采集、分析荧光信号并绘制温度熔解曲线,根据不同熔解曲线形状来区分(单个)碱基差异。
*广泛的 HRM 分析应用领域是基因筛查。基因筛查是搜索 PCR 扩增片段中是否存在未知变异,它可在测序步骤之前进行或者作为替代测序方法。由于 PCR 产物突变可导致 DNA 熔解曲线的形状改变,因此它可以利用 HRM分析检测。杂交双链 DNA 样本扩增并熔解时,其熔解曲线不同于纯合野生型或突变样本。如果操作得当,可以减少至少95%的测序工作量。随着DNA染料和分析仪器的发展,HRM技术还将继续完善和改进,在遗传病分子诊断领域发挥更多的作用。
HRM应用:
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• 基因筛查 (突变研究)
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• 杂合性研究
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• 突变分析
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• 物种鉴定
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• 单核苷酸多态性 (SNP) 检测
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• 甲基化分析
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作为专注于PCR领域超过24年的高品质试剂供应商,Solis BioDyne为您推荐,5X热启动EvaGreen高分辨率熔解曲线分析-预混Mix(PCR):
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名称
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货号
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兼容的PCR仪器
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5x HOT FIREPol EvaGreen HRM Mix (NO ROX)
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08-31-00001
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Bio-Rad: CFX96™ & CFX384™
Qiagen: Rotor-Gene® 6000
Eppendorf: Mastercycler®: ep realplex2 & ep realplex4
Illumina: The Eco™
Roche: LightCycler® 480
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* 不含参比染料ROX,如需要含ROX,请选择:08-33-00001
5X热启动EvaGreen高分辨率熔解曲线分析-预混Mix(PCR)提供如下组分:
极高的性价比(进口品质,国产价格):
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品牌
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货号
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规格
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目录价(元)
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单次反应价格(元)
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Solis BioDyne
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08-31-00001
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1ml(250次)
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386
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1.54
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Thermo
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4415452
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5*5ml(2500次)
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18856
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7.54
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Qiagen
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206546
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25ml(2000次)
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21810
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10.9
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DBI
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DBI-2232
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1000次
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11000
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11
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天根(Tiangen)
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FP210-02
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500次
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2480
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4.96
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宇恒生物(UE)
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S2013
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500次
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2300
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4.6
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推荐的qPCR反应体系配置:
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组分
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体积
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终浓度
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5x HOT FIREPol® EvaGreen® HRM Mix
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4 µl
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1x
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正向引物 (10 pmol/µl)
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0.16-0.5 µl
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80-250 nM
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反向引物 (10 pmol/µl)
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0.16-0.5 µl
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80-250 nM
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DNA模板
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可变
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可变
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H2O(PCR级)
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up to 20 µl
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Total
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20 µl
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* DNA模板浓度:cDNA 0.1 pg/μl -10 ng/μl ; gDNA 10 pg/μl – 4 ng/μl
推荐的qPCR反应程序:
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循环步骤
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温度
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时间
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循环数
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起始激活(热启动)
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95ºC
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12 min
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1
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变性
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95ºC
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15 s
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40
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退火
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60º-65ºC
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20 s
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延伸
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72ºC
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20 s
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发表文章实验结果展示:
【1】Negrisolo, Susanna et al. “Could the interaction between LMX1B and PAX2 influence the severity of renal symptoms?” European Journal of Human Genetics 26 (2018): 1708-1712.
使用Solis试剂盒,分析PAX2基因4号外显子的错义突变
【2】Gaczkowska, Agnieszka, et al. “Association of CDKAL1 Nucleotide Variants with the Risk of Non-Syndromic Cleft Lip with or without Cleft Palate.” Journal of Human Genetics, vol. 63, no. 4, 2018, pp. 397–406.
使用Solis试剂盒,分析CDKAL1基因SNP
HRM分析成功的关键:
1.保持较短的扩增片段,实现*高的灵敏度。与较大的扩增片段相比,100 bp 左右的扩增片段可简化单核苷酸熔解曲线的检测。
2.确保 PCR 扩增片段的特异性。错配产物和引物二聚体可使数据解释复杂化。引物浓度低于 200nM,MgCl2 在 1.5 mM至3 mM 范围及使用热启动DNA 聚合酶将有助于获得高特异性。
3.确保反应使用足够的模板。一般而言,Ct 应低于30,以生成足够的材料,实现准确的熔解分析。
除了上述的高效稳健的HRM分析预混Mix产品,Solis BioDyne为客户提供终点PCR(end-point PCR),qPCR(real-time PCR),反转录PCR(Reverse transcription),以及其它PCR所需的配套试剂。产品线纵览图如下:
Solis BioDyne来源于欧盟-爱沙尼亚共和国,专注PCR领域超过24年,Solis BioDyne一直致力于开发和生产高品质的生命科学试剂,现已成为当今欧洲优越的试剂供应商之一。高标准的生产标准和服务使Solis BioDyne成为全球值得信赖的优选PCR供应商。我们的DNA聚合酶,PCR Master Mixes,qPCR Mixes和其它试剂被全球110多个国家的研究者所使用,包括**研究机构和生物技术公司。
Solis BioDyne拥有一家的蛋白质稳定技术砖利,确保其PCR酶与PCR Mixes产品具有极高的稳定性,研究者可以常温运输以及常温下配置PCR反应体系(无需冰盒)。即使是室温放置30天,其酶活性也没有损耗。
作为Solis BioDyne在中国的区域总代理,艾美捷科技有限公司将为中国客户提供***的Solis BioDyne产品以及订制服务。