二氧化氯净化副产物的危害：
二氧化氯副产物主要是ClO2- ClO3-，而其中ClO2-的作用*强，但较氯气所产生的副产物小的多。
高剂量的二氧化氯可能会在人体内产生过量氧化氢，将液体中的单质碘氧化成活性形成，活性碘会与胃肠中的有机营养物结合成碘化有机物，从而干扰碘的吸收代谢并抑制其生理活性，抑制甲状腺素的分泌而导致血清中甲状腺素的降低，引起胎儿脑质增生。当饮食中脂肪和钙的含量较高时，二氧化氯还可使血液中的胆固醇浓度升高和增大血小板个体，增加心血管病。患病率，损害肝、肾和**神经系统。**副产物亚氯酸有较大的毒理学影响。亚氯酸盐能使红细胞氧化变性成为无色的正铁血红蛋白，引起溶血性贫血，导致生物个体成加速度减慢和幼胎夭折！还能影响肝功能和**反应，毒害性腺使含硫基因受抑制，肝产生坏死病变，肾和心肌营养**。亚氯酸盐被国际癌症研究所确定为致癌物类。氯酸盐属于中等毒性的化合物，会引起肾功能衰竭。（因为氯酸盐被用作除草剂，所以有大量的关于氯酸盐毒性的报道。其症状包括高铁血红蛋白症，无尿，腹部疼痛，肾衰竭。成年人口服剂量为20g氯酸钠，相当于230mg氯酸根/kg体重。）
二氧化氯，氯酸和亚氯酸的综合作用能引起质突变，使精子畸形，血液和尿液化学成分异常。因此有些人认为二氧化氯**的危险潜在不亚于加氯。不过上述研究结果都是在较高浓度和较高的摄入剂量下获得的。当浓度低于2 mg/L时，并没有观察到对实验个体有显著的生理影响。另外据研究在低于5 mg/L 的浓度时，二氧化氯、氯酸和亚氯酸在生物体的蓄积作用，亚慢性中毒和致突变作用都不明显。所以在采用二氧化氯**时，如果严格控制管网中的ClO2、ClO3-、ClO2-的含量，则应当是能保证饮用水**的。目前根据实验数据，认为**浓度的界限为10~~100mg/L 由于二氧化氯在水溶液中消耗较快，世界卫生组织认为设置亚氯酸盐指标限值已能保证毒性**要求，可不用进一步设置其他毒理准则（新国标0.7 mg/L）
据研究，所生成的亚氯酸盐和氯酸盐的数量还与总有机碳含量有关，当二氧化氯与总机碳的比例低于0.4时水处理效果*佳。所以有人建议在投二氧化氯后采用活性碳或其他还原剂（如亚铁盐）进行后续处理。（一些发达国家严格控制二氧化氯的投加量，USEPA规定饮用水中的二氧化氯、亚氯酸盐、氯酸盐的总量不得超过1mg/L，并推荐二氧化氯的纯度*少大于95%，德国规定饮用水中的亚氯酸盐和氯酸盐相加的总量不能超过2mg/L。）