1. 安放
光学显微镜的使用我们都不陌生，但是生物显微镜的正确安放方法恐怕就不是任何人都可以完全清楚的。首先右手要牢牢的握住镜臂，同时左手托住底座，这时一定要保持镜体的直立，然后轻轻的放置在清洁、平稳的桌面上。这里还有一个技巧，选择安放显微镜的位置*好是临窗或者光线充足的地方，以方便观察。如果尼康显微镜是单筒的话，*好是选择放在身体的左侧，距离桌边保持3~4厘米为佳。
2. 清洁
尼康显微镜的清洁也是非常重要的。首先要先检查一下显微镜是否有破损或毁坏的地方，是否需要清洁。对于确实需要清洁的显微镜在清洁镜身机械部分时可选择使用干净软布，以免划伤镜身。对于透镜部分则需要用擦镜纸擦拭，遇到胶或粘污时，可适当选用少量的二甲苯协助清洁。
3. 对光
对光并不是所有的奥林巴斯显微镜都需要的步骤，如果您使用的显微镜本身就带有光源的话，就可以直接跳过此步骤，但记得需要调节光亮度的旋钮。
对于需要对光的显微镜来说，对光时首先将镜筒升至载物台上方1~2厘米处，然后将低倍镜对准光孔，接下来调节光圈和反光镜。这时需要注意的是反光镜要用双手转动。在挑选反光镜时也需要考虑到光线的影响，当光线强时要用平面镜，相对的，当光线弱时，可挑用凹面镜。