实际操作中，偏光显微镜上下偏振镜的振动方向要互相正交，或东西和南北方向，各自与目镜十字丝的横、纵方向一致。有时只用一个下偏振镜来观测，必须确定下偏振镜的振动方向，所以操作时必须对偏振镜进行校正。
一、目镜十字丝的检测
通常要检查目镜十字丝是否正交，以及是否与上下偏振镜振动方向一致，同时选一块解理和清晰的黑云母，移至目镜十字丝的中心，将解理缝平行于十字丝的一根丝，记下载物台的刻度数，再转动载物台使解理缝平行于另一十字丝，记下载物台的刻度数，两个刻度数之差为90°，说明十字丝正交。
二、下偏振镜振动方向的确定和校正
用黑云母来检查下偏振镜的振动方向，这是因为黑云母是一种分布广泛的透明矿物，在单偏光下很有特征:首先找一块解理和清晰的黑云母，移至目镜十字丝中心，推出上偏光镜，转动载物台一周，观察黑云母颜色的变化，因为黑云母对解理方向的振动光吸收*强，所以使黑云母颜色达到*深时，解理缝的方向就是下偏光镜的振动方向。
三、上下偏振镜正交的校正
下偏振镜的方向校���好之后，取下薄片，推入上偏振镜，观察视域是否处于消光状态，如果全黑，则表明上下偏光的振动方向互相正交，否则，上偏振镜须进行校正，即转动上偏振镜，使视域达到*暗为止。转动时必须先松开上偏振镜的止动螺丝，校正好后再拧紧。
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