双光束核酸蛋白检测仪以两束光一束通过样品、另一束通过参考溶液的方式来分析样品的核酸蛋白检测仪。这种方式可以克服光源不稳定性、某些杂质干扰因素等影响，还可以检测样品随时间的变化等；双光束分光光度计一般都能自动记录吸收光谱曲线。由于两束光同时分别通过参比池和样品池，还能自动梢除光源强度变化所引起的误差。
单光束核酸蛋白检测仪是由一束经过单色器的光，轮流通过参比溶液和样品溶液，以进行光强度测量。这种核酸蛋白检测仪的特点是：结构简单，价格便宜，主要适于做定量分析；但是其不足的地方是测量结果受电源的波动影响较大，容易给定量结果带来较大误差，此外，这种仪器操作麻烦，不适于做定性分析。
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