表观遗传学研究的核心及试图解答的问题是中心法则中从基因组向转录组传递遗传信息的调控机制。其实归纳起来就是”转录和转录后调控“。
也非常容易理解，上面提到的都是参与转录和转录后调控的元件。转录其实就是DNA在蛋白（酶，蛋白因子）作用下变成RNA的过程，因此研究对象无外乎3种：DNA，蛋白和RNA。
DNA的话，其实主要就研究DNA甲基化和染色质重塑，实验技术主要为甲基化PCR和ChIP(染色质**沉淀)；
蛋白的话，主要研究组蛋白的修饰和一些转录因子和调控因子蛋白，组蛋白修饰就是大家*常听说的甲基化，乙酰化，磷酸化等。当前用的*多的技术是Western blot和ChIP；如果研究的是RNA结合蛋白可能还需要使用RIP技术（RNA**沉淀）。
RNA的话，指非编码RNA的调控，主要包括两类，一类是短RNA（miRNA），现在依然有很多课题组在研究，只是没有前几年那么火了。另一类是长非编码RNA（lncRNA），*近几年研究的特别火。实验方法主要为RIP技术（RNA**沉淀技术，主要针对细胞total RNA，适用于miRNA和lncRNA研究），或nuclear RIP技术（核RNA**沉淀，主要针对lncRNA研究），然后再结合测序（Sequence），从而发现新的miRNA和lncRNA。
虽然上述仍是研究RNA调控的主要手段，但是由于测序技术的大量开展，无论是miRNA还是lncRNA，都已经发现了好几万种，因此目前RNA研究重点也已发生了调整，由发现新的miRNA和lncRNA转向对其功能的深入研究。以lncRNA举例，大家当前对lncRNA结合的蛋白和基因组DNA更感兴趣，主要实验方法为CHIRP技术（Chromatin Isolation by RNA Purification，RNA纯化染色质分离技术），结合质谱分析（MS）或测序（Seq）进行RNA导向的蛋白质组或基因组学研究。2015年Cell上报道通过ChIRP-MS 鉴定特定lincRNA Xist 结合的81种内源性蛋白。
RNA甲基化m6A RNA，这种甲基化一个重要特征是”可逆的甲基化“，RNA甲基化研究主要集中在3种蛋白，甲基化酶，去甲基化酶， 识别并结合甲基化RNA的蛋白（称为“阅读器”，reader）。一般*常使用的方法为MeRIP（甲基化RNA**沉淀）。
七叶树皂苷B 标准品别名： 英文名称： Aesculuside B CAS 编号： 26339-92-4
丹参酮IIA 标准品别名： 英文名称： Tanshinone IIA CAS 编号： 568-72-9
原百部碱 标准品别名： 英文名称： protostemonine CAS 编号： 27495-40-5
白屈菜碱 标准品别名： 英文名称： Chelidonine CAS 编号： 476-32-4
桑皮苷A 标准品别名： 英文名称： mulberroside A CAS 编号： 102841-42-9
11-羰基-Β-乙酰乳香酸 标准品别名： AKBA 英文名称： Acetyl-11-keto--boswellic acid CAS 编号： 67416-61-9
维生素A 标准品别名： 视黄醇 英文名称： Vitamin A CAS 编号： 68-26-8
25-羟基原人参二醇 标准品别名： 英文名称： 25-OH-PPD CAS 编号：
高香草酸 标准品别名： 英文名称： Homovanillic acid CAS 编号： 306-08-1
油酸 标准品别名： 英文名称： cis-9-Octadecenoic acid CAS 编号： 112-80-1
酸枣仁皂苷A 标准品别名： 英文名称： Jujuboside A CAS 编号： 55466-04-1
胡麻属苷 标准品别名： 英文名称： Sesamoside CAS 编号： 117479-87-5
吴茱萸新碱 标准品别名： 吴茱萸卡品碱、吴茱萸喹酮碱 英文名称： Evocarpine CAS 编号： 15266-38-3
巴马亭红碱 标准品别名： 英文名称： Palmatrubine CAS 编号： 16176-68-4
积雪草酸 标准品别名： 亚细亚酸、积血草酸、亚洲积雪草酸 英文名称： Asiatic acid CAS 编号： 464-92-6
香叶醇 标准品别名： 牻牛儿醇;香天竺蔡醇；牛儿醇 英文名称： Geraniol CAS 编号： 106-24-1
肉豆蔻醚 标准品别名： 5-甲氧黃樟油精、5-甲氧樟油精、5-烯丙基-2,3-(亚甲二氧基)苯甲醚 英文名称： Myristicin CAS 编号： 607-91-0
马来酸 标准品别名： 顺丁烯二酸、(Z)-2-丁烯二酸、失水苹果酸、顺酸、异丁烯二酸、顺丁烯二酸 英文名称： Maleic acid CAS 编号： 110-16-7
(-)-丁香树脂酚-4-O-β-D-呋喃芹糖基-(1→2)-β-D-吡喃葡萄糖苷 标准品别名： 英文名称： (-)-Syringaresnol-4-O-β-D-apiofuranosyl-(1→2)-β-D-glucopyranoside CAS 编号： 136997-64-3
褪黑素 标准品别名： 英文名称： Melatonine CAS 编号： 73-31-4
7-表紫杉醇 标准品别名： 7-差向紫杉醇 英文名称： 7-Epitaxol CAS 编号： 105454-04-4