Offline Sorter
产品简介
Offline Sorter(OFS)是目前业内*受认可和信赖的离线Spike Sorting软件,超过800篇的出版引证了OFS的方法。OFS还兼容其他很多数据采集公司的系统和软件程序获得的文件类型。
产品详细信息
Offline Sorter(OFS)是目前业内*受认可和信赖的离线Spike Sorting软件,超过800篇的出版引证了OFS的方法。OFS还兼容其他很多数据采集公司的系统和软件程序获得的文件类型。
现在的OFS v3是一款功能强大,易于使用的用于查看和分选动作电位波形(Spike)的工具,这些波形是之前通过single electrodes, stereotrodes 和 tetrodes采集得到的。Spike以“点”的形式显示在两维(2D)或三维(3D)的特征空间中,手动,半自动或全自动的聚类方法可以应用于对Spike的分类。OFS也可以使用各种不同的阈值方法,从连续记录的神经数据中提取Spike。 OFS允许通过一系列的显示进行Sorting验证,并可以计算聚类分离统计参数和质量指标。经过Sorting的Spike可以导出多种格式以进行后续分析。
全自动分类算法的参数空间会通过图形显示质量指标的方法被自动扫描。自动扫描的结果可以保存为. SCAN文件。由于结合了新的批处理模式的命令,这个过程允许各种算法的运行。在快速手动Sorting之后,为每个通道对手动的分类结果选择合适的分类。
OFS v3也包含了全新的波形时间段显示方式,包括cluster vs. time和sort quality vs. time,这样就显示出波形随时间变化和发展的情况。有多种从连续数据中检测Spike的方法可以被应用到,包括电压阈值、信号能量和非线性能量。并且支持stereotrode和tetrode 的Spike 检测。在Spike提取之前,低切滤波器可以被应用到获取连续数据。
Powerful waveform viewing and sorting
强大的波形显示和分类功能
n 运用principal component projections、voltage slices in time、或者其他20多种波形参数(如: peak, valley, full-width at half maximum)的方法,在3D特征空间内进行手动聚类。
n Box sorting方法
n 在time-voltage空间内进行波形选择
n Template模板匹配算法
n Tetrode 和 Stereotrode 的波形提取
n 神经元互相关分析和ISI放电间隔
n 2D和3D空间内显示波形密度
n 波形校正
n 去除小于ISI放电间隔的波形和运动噪音
n Raster 显示Spike和连续数据
n Sorting结果可导入PowerPoint中,并可打印
n Sorting的统计数据
n 波形特征和Sorting的统计数据可导入到MATLAB®, Excel® 或text 中
n Sorting结果可导入到NeuroExplorer中
n 对于任一通道可保存和调出特定的Sorting方法
Time segmentation, adaptive sorting methods, and time-dependent analysis
n 将文件分割成时间片段,对每个时间片段单独的查看和Sorting
n Clusters vs. Time view显示出聚类随着时间的变化发展
n Sort Quality vs. Time Segment graph 显示出sort quality 随时间的变化
n Adaptive template sorting
n Template vs. Time view
Semi-automatic and automatic sorting 半自动和全自动Sorting
n 全自动分类算法的参数空间会通过图形显示质量指标的方法被自动扫描,为每个通道对手动的分类结果选择合适的分类
n 自动扫描的结果可以保存为. SCAN文件。由于结合了新的批处理模式的命令,这个过程允许各种算法的运行。在快速手动Sorting之后,为每个通道对手动的分类结果选择合适的分类。
n 全自动分类方法包括valley seeking 、T-Distribution Expectation Maximization (E-M)等算法。
n 半自动分类方法运用K-means、Standard E-M等算法。
技术参数:
特点: |
详细描述: |
备注: |
支持的文件类型: |
Plexon (.PLX, .DDT), NeuroExplorer® (.NEX), Alpha Omega (.MAP, .MPX), Axion Biosystems (.SPK, .RAW), Cyberkinetics/Blackrock Microsystems (.NEV), CED Spike-2 (.SMR), DataWave (.UFF, .DAT, .CUT, .ACT), Neuralynx (.NTT, .NST, .NCS, .NVT), MultiChannel Systems (.MCS, .MCD), Panasonic (.MED), Neuroshare (.NSN), generic binary continuous data等 |
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Spike检测方法: |
电压阈值、信号能量和非线性能量 |
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Spike sorting 方法: |
手动方法包括: boxes, waveform crossing and contours. 全自动方法包括: valley-seeking, T-distribution E-M, and scanning methods. |
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可用参数: |
• Projections onto principal components (PCA) |
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显示窗口: |
Waveform View, Units View, Timeline View, Info Grid Views, Clusters Views, Surface View, Clusters Vs Time, Sort Quality vs Segment Graph, Waveform Inspection View, Waveform Detection View, Continuous Frequency Spectrum View, ISI Histograms View, Feature vs. Feature View, Sorting Summary View, PCA Results View, Cross-Correlograms View, and Rasters View |
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支持的电极种类: |
Single, stereotrode和 tetrode |
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文件导出: |
MATLAB®, Excel® 、text file |
波形特征和统计数据均可被导出 |
电脑配置要求: |
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CPU: |
Pentium® III 或更高 |
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操作系统: |
Windows® XP 、XP64, Windows 2000, 、 Windows Vista (32-bit or 64-bit) |
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内存: |
至少1G |
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电子key: |
需要Plexon的电子key |
一套软件会配送两个电子key |