一.根类药材
1. 组织构造
大多为被子植物的根，首先根据维管组织特征，区别其为双子叶植物根的初生构造、次生构造或为单子叶植物根。
（1）双子叶植物根类 多数双子叶植物根类药材为次生构造，表层为木栓组织；皮层狭窄；韧皮部较发达或较狭窄；形成层环多明显；木质部由导管、管胞、木纤维、木薄壁细胞及木射线组成；中央大多无髓，少数有明显的髓部。
少数双子叶植物根类药材为初生构造，皮层宽，中柱小，木质部束及韧皮部束数目少，相间排列，初生木质部呈星芒状，一般无髓。
有些双子叶植物根有异常三生构造，例如何首乌根的形成层环外方有数个异常复合维管束。
（2）单子叶植物根类单子叶植物根类药材一般无木栓组织，其表皮细胞外壁有时增厚，也有表皮发育成数列根被细胞，壁木栓化或木化；皮层宽广，占根的大部分；内皮层凯氏点 ( 带 ) 通常明显；中柱小；木质部束及韧皮部束数目多，相间排列成一圈；中央髓部大多为薄壁细胞或细胞壁木化增厚。
根类药材常有分泌组织，大多分布于韧皮部，包括乳汁管、树脂道、油室或油管、油细胞等。根类药材中常有各种草酸钙结晶，包括簇晶、方晶、砂晶、针晶等。此外，纤维、石细胞及淀粉粒、菊糖的有无及形状亦宜注意。
2.粉末特征
除了无叶肉组织外，其它细胞、组织碎片都有可能存在。根的木栓组织多见，应注意木栓细胞表面观的形状、颜色、壁的厚度。导管一般较粗，应注意其类型、直径、导管分子的长度及末端壁的穿孔、纹孔的形状及排列等。石细胞应注意形状、大小、细胞壁增厚形态和程度、纹孔形状及大小、孔沟密度等特征。纤维观察时要注意纤维的形状、长短、粗细、端壁、胞壁增厚的程度及性质、纹孔类型、孔沟形态、排列等特征；同时还要注意纤维束的周围细胞是否含有结晶形成晶鞘纤维。分泌组织观察时应注意分泌细胞、分泌腔（室）、分泌管（道）及乳汁管的类型 、分 泌细胞的形状、分泌物的颜色、周围细胞的排列及形态等特征。 结晶大多为草酸钙结晶，其次还有 菊糖、 硅质晶体等，应注意结晶的类型、大小、排列及含晶细胞的形态等。 淀粉粒一般较小，应注意淀粉粒的多少、形状、类型、大小、脐点形状及位置、层纹等特征。
根类药材的根头部如附有叶柄、茎的残基或着生毛茸，在粉末中可见到叶柄的表皮组织、气孔及毛茸。
二.根茎类药材
1. 组织构造
是以被子植物地下茎入药，包括根状茎（根茎）、块茎、鳞茎及球茎，以根茎多见。首先根据中柱、维管束的类型，区别其为蕨类植物、双子叶植物或单子叶植物的根茎。
蕨类植物根茎的*外层，多为厚壁性的表皮及下皮细胞，基本薄壁组织较发达。中柱的类型，有的是原生中柱，木质部 ( 只有管胞 ) 位于中心，韧皮部位于四周，外有中柱鞘及内皮层；有的为网状中柱，在横切面可见数个分体中柱断续排列成环状，每一分体中柱为一原生中柱状。根茎表面鳞片的形状、边缘特征有一定鉴别意义。
双子叶植物根茎大多有木栓组织；皮层中有时可见根迹维管束；中柱维管束无限外韧型，环列；中心有髓。少数种类有三生构造。
单子叶植物根茎的*外层多为表皮，皮层中有叶迹维管束，内皮层大多明显，中柱中散有多数有限外韧型维管束或周木型维管束。较粗的根茎、块茎等的内皮层不明显。鳞茎的鳞叶表皮可见气孔。
有的根茎类药材有油室或油细胞；有的含草酸钙针晶束，针晶束大多存在于粘液细胞中。此外，对厚壁组织、导管以及草酸钙结晶的类型等均应注意。
2. 粉末特征
与根类相似。注意鳞茎、块茎、球茎常含多量较大的淀粉粒，其形状、大小、脐点、层纹以及复粒、半复粒、多脐点单粒等特征是鉴别的重要依据。鳞茎的鳞叶表皮常可察见气孔。单子叶植物根茎较易见到环纹导管。蕨类植物根茎只有管胞。
三.茎藤类药材
1. 组织构造
大多为双子叶植物草本茎或木本茎，少数为单子叶植物茎。首先根据维管束的类型及排列，区别其为双子叶植物茎或单子叶植物茎。
双子叶植物草质茎大多有表皮，应注意细胞形状、外壁增厚、气孔及有无毛茸等；皮层为初生皮层，其外侧常分化为厚角组织；中柱鞘常分化为纤维或夹杂有石细胞；束中形成层明显；次生韧皮部大多成束状或板状；髓较大。
木质茎*外为木栓组织；皮层多为次生皮层；中柱鞘厚壁组织多连续成环或断续；形成层环明显；次生韧皮部及次生木质部呈筒状结构；射线较窄，细胞壁常木化；髓较小。
木质藤本茎的木栓层较厚，有的有落皮层；维管组织被射线分隔成明显的放射状纹，导管孔较大，有髓周厚壁细胞等。
此外，双子叶植物茎的观察还应注意有无分泌组织、草酸钙结晶、淀粉粒、树脂及色素物等。
单子叶植物茎*外层为表皮，表皮下如有下皮厚壁细胞常为鉴别特征，其内基本组织中散生多数有限外韧维管束，中央无髓。
裸子植物茎的木质部主为管胞，通常无导管，但麻黄茎的构造与双子叶植物草质茎类同。
2. 粉末特征
除了无叶肉组织外，其它组织一般都可能存在。
四.皮类药材
1. 组织构造
皮类药材是木本植物形成层以外的部分，通常包括木栓组织、皮层及韧皮部。观察木栓组织应注意木栓细胞的层数、颜色、细胞壁的增厚程度等。皮层一般较狭窄，通常是由栓内层形成的次生皮层。韧皮部占皮的绝大部分，应注意韧皮射线的宽度 ( 细胞列数 ) 、射线细胞的形状、壁厚度、纹孔、内含物等。韧皮部及皮层往往有厚壁组织（纤维或石细胞）存在；有的皮类药材的韧皮部中，纤维或石细胞切向集结成若干层带 ( 硬韧部 ) ，与筛管群、薄壁组织 ( 软韧部 ) 相间排列。
皮类药材常有树脂道、油细胞、乳汁管等分泌组织以及草酸钙结晶。多数皮类药材含淀粉粒，但较微小。
2. 粉末特征
主要有木栓细胞、纤维、石细胞、分泌组织及草酸钙结晶等。筛管分子端壁复筛板的筛域常可察见，松科植物筛胞侧壁上的筛域亦易见。一般不应有木质部的组织，如导管、管胞等。
五.木类药材
木类药材指木本植物树干、根形成层以内的所有组织，即主要为次生木质部木材。药用一般为心材。次生木质部的主要组成有轴向系统的导管、管胞、纤维、木薄壁细胞及径向系统的射线薄壁细胞。
1. 组织构造
木类药材通常从三个切面观察组织构造。横切面主要观察木射线宽度 ( 细胞列数 ) 、密度，导管与木薄壁细胞的比例及分布型式，导管和木纤维的形状、直径等；切向纵切面主要观察木射线的宽度、高度及类型，木射线在切向纵切面呈梭形，其宽度是指*宽处的细胞数，高度是指从上至下的细胞数，同时观察导管、木纤维等；径向纵切面主要观察木射线的高度及细胞类型 ( 同型细胞射线或异型细胞射线 ) ，木射线在径向纵切面呈横带状，与轴向的导管、木纤维、木薄壁细胞相垂直，同时观察导管的类型，导管分子的长短、直径及有无侵填体，木纤维的类型及大小、壁厚度、纹孔等。
2. 粉末特征
以导管、木纤维、木薄壁细胞、木射线细胞的形态特征，以及细胞后含物为主要鉴别点。
六.叶类药材
1. 组织构造
通常作横切片观察表皮、叶肉及叶脉的组织构造，要注意上、下表皮细胞的形状、大小、外壁、气孔、角质层厚度，以及有无内含物，特别是毛茸的类型及其特征。
2. 叶的表面制片
主要观察表皮细胞、气孔及各种毛茸的全形，以及叶肉组织的某些鉴别点，如草酸钙结晶类型及其分布等。应注意上、下表皮细胞的形状，垂周壁，角质层纹理，气孔的型式。毛茸为叶类药材的重要鉴别特征，应注意观察非腺毛、腺毛的细胞形状、细胞壁的厚度及其表面特征。
另外，观察叶的表面制片，可用以测定栅表细胞比、气孔数、气孔指数及脉岛数，对鉴别亲缘相近的同属植物的叶，有一定参考意义。
3. 粉末特征
与叶的表面制片基本一致，但毛茸多碎断，粉末中还可见到叶片的横断面及晶体。
七.花类药材
1. 花类药材的显微鉴定
根据不同的目的物，将苞片、花萼、花冠、雄蕊或雌蕊等分别作表面制片，或将完整的花作表面制片观察。苞片、花萼的构造，与叶相似。花粉粒为花类药材的重要特征，应注意其形状、大小、萌发孔状况、外壁雕纹等。
八.果实类药材
1.组织构造
一般观察果皮的组织特征。由子房壁分化和增大形成的真果的果皮，可分为外果皮、中果皮及内果皮，内、外果皮相当于叶的上、下表皮，中果皮相当于叶肉。
外果皮为 1 列表皮细胞，观察注意点同叶。中果皮为多列薄壁细胞，有细小维管束散布；中果皮中常有分泌组织及厚壁组织分布。内果皮的变异较大，有的为 1 列薄壁细胞，有的散在石细胞或结晶细胞层等。
2. 粉末特征
观察外果皮应注意细胞的形状、垂周壁的增厚状况、角质层纹理以及非腺毛、腺毛的有无及其特征；中果皮应注意分泌组织、厚壁组织及结晶的特征；内果皮注意细胞的形态与类型。对含有种子的果实类药材，还应注意种皮、胚乳组织等特征。
九.种子类药材
1. 组织构造
着重观察种皮的构造。有的种皮只有 1 列细胞，较多的种皮由数种不同的细胞组织构成。
种子的外胚乳、内胚乳或子叶细胞的形状、细胞壁增厚状况，以及所含脂肪油、糊粉粒或淀粉粒等，也有鉴别意义。
2. 粉末特征
注意种皮的表面观及断面观形态特征。其次应注意种皮支持细胞、油细胞、色素细胞的有无和形态；有无毛茸、草酸钙结晶、淀粉粒、分泌组织碎片等。
十.全草类药材
大多为草本植物的地上部分，少数为带根的全株。全草类包括了草本植物药的各个部位，其显微鉴定可参照以上各类药材的鉴别特征。
十一.菌类药材
大多以子实体或菌核的形式入药，无淀粉粒和高等植物的显微特征。观察时应注意菌丝的形状、有无分枝、颜色、大小；团块、孢子的形态；结晶的有无及形态、大小与类型。
十二.动物类药材
因药用部位不同，有动物体、分泌物、病理产物和角甲类之分。
动物全体应注意皮肤碎片细胞的形状与色素颗粒的颜色，肌纤维的形态，刚毛的形态、大小及颜色，体壁碎片颜色、表面纹理及菌丝体，骨碎片，骨陷窝的形态等。带有鳞片的动物体还应注意鳞片角质增厚特征。
分泌物和病理产物应注意团块的颜色及其包埋物的性质特征，表皮脱落组织，毛茸及其它细胞的形状、大小、颜色等特征。
角甲类药材应注意碎块的形状、颜色、横断面和纵断面观的形态特征及色素颗粒颜色等。
1. 组织构造
大多为被子植物的根，首先根据维管组织特征，区别其为双子叶植物根的初生构造、次生构造或为单子叶植物根。
（1）双子叶植物根类 多数双子叶植物根类药材为次生构造，表层为木栓组织；皮层狭窄；韧皮部较发达或较狭窄；形成层环多明显；木质部由导管、管胞、木纤维、木薄壁细胞及木射线组成；中央大多无髓，少数有明显的髓部。
少数双子叶植物根类药材为初生构造，皮层宽，中柱小，木质部束及韧皮部束数目少，相间排列，初生木质部呈星芒状，一般无髓。
有些双子叶植物根有异常三生构造，例如何首乌根的形成层环外方有数个异常复合维管束。
（2）单子叶植物根类单子叶植物根类药材一般无木栓组织，其表皮细胞外壁有时增厚，也有表皮发育成数列根被细胞，壁木栓化或木化；皮层宽广，占根的大部分；内皮层凯氏点 ( 带 ) 通常明显；中柱小；木质部束及韧皮部束数目多，相间排列成一圈；中央髓部大多为薄壁细胞或细胞壁木化增厚。
根类药材常有分泌组织，大多分布于韧皮部，包括乳汁管、树脂道、油室或油管、油细胞等。根类药材中常有各种草酸钙结晶，包括簇晶、方晶、砂晶、针晶等。此外，纤维、石细胞及淀粉粒、菊糖的有无及形状亦宜注意。
2.粉末特征
除了无叶肉组织外，其它细胞、组织碎片都有可能存在。根的木栓组织多见，应注意木栓细胞表面观的形状、颜色、壁的厚度。导管一般较粗，应注意其类型、直径、导管分子的长度及末端壁的穿孔、纹孔的形状及排列等。石细胞应注意形状、大小、细胞壁增厚形态和程度、纹孔形状及大小、孔沟密度等特征。纤维观察时要注意纤维的形状、长短、粗细、端壁、胞壁增厚的程度及性质、纹孔类型、孔沟形态、排列等特征；同时还要注意纤维束的周围细胞是否含有结晶形成晶鞘纤维。分泌组织观察时应注意分泌细胞、分泌腔（室）、分泌管（道）及乳汁管的类型 、分 泌细胞的形状、分泌物的颜色、周围细胞的排列及形态等特征。 结晶大多为草酸钙结晶，其次还有 菊糖、 硅质晶体等，应注意结晶的类型、大小、排列及含晶细胞的形态等。 淀粉粒一般较小，应注意淀粉粒的多少、形状、类型、大小、脐点形状及位置、层纹等特征。
根类药材的根头部如附有叶柄、茎的残基或着生毛茸，在粉末中可见到叶柄的表皮组织、气孔及毛茸。
二.根茎类药材
1. 组织构造
是以被子植物地下茎入药，包括根状茎（根茎）、块茎、鳞茎及球茎，以根茎多见。首先根据中柱、维管束的类型，区别其为蕨类植物、双子叶植物或单子叶植物的根茎。
蕨类植物根茎的*外层，多为厚壁性的表皮及下皮细胞，基本薄壁组织较发达。中柱的类型，有的是原生中柱，木质部 ( 只有管胞 ) 位于中心，韧皮部位于四周，外有中柱鞘及内皮层；有的为网状中柱，在横切面可见数个分体中柱断续排列成环状，每一分体中柱为一原生中柱状。根茎表面鳞片的形状、边缘特征有一定鉴别意义。
双子叶植物根茎大多有木栓组织；皮层中有时可见根迹维管束；中柱维管束无限外韧型，环列；中心有髓。少数种类有三生构造。
单子叶植物根茎的*外层多为表皮，皮层中有叶迹维管束，内皮层大多明显，中柱中散有多数有限外韧型维管束或周木型维管束。较粗的根茎、块茎等的内皮层不明显。鳞茎的鳞叶表皮可见气孔。
有的根茎类药材有油室或油细胞；有的含草酸钙针晶束，针晶束大多存在于粘液细胞中。此外，对厚壁组织、导管以及草酸钙结晶的类型等均应注意。
2. 粉末特征
与根类相似。注意鳞茎、块茎、球茎常含多量较大的淀粉粒，其形状、大小、脐点、层纹以及复粒、半复粒、多脐点单粒等特征是鉴别的重要依据。鳞茎的鳞叶表皮常可察见气孔。单子叶植物根茎较易见到环纹导管。蕨类植物根茎只有管胞。
三.茎藤类药材
1. 组织构造
大多为双子叶植物草本茎或木本茎，少数为单子叶植物茎。首先根据维管束的类型及排列，区别其为双子叶植物茎或单子叶植物茎。
双子叶植物草质茎大多有表皮，应注意细胞形状、外壁增厚、气孔及有无毛茸等；皮层为初生皮层，其外侧常分化为厚角组织；中柱鞘常分化为纤维或夹杂有石细胞；束中形成层明显；次生韧皮部大多成束状或板状；髓较大。
木质茎*外为木栓组织；皮层多为次生皮层；中柱鞘厚壁组织多连续成环或断续；形成层环明显；次生韧皮部及次生木质部呈筒状结构；射线较窄，细胞壁常木化；髓较小。
木质藤本茎的木栓层较厚，有的有落皮层；维管组织被射线分隔成明显的放射状纹，导管孔较大，有髓周厚壁细胞等。
此外，双子叶植物茎的观察还应注意有无分泌组织、草酸钙结晶、淀粉粒、树脂及色素物等。
单子叶植物茎*外层为表皮，表皮下如有下皮厚壁细胞常为鉴别特征，其内基本组织中散生多数有限外韧维管束，中央无髓。
裸子植物茎的木质部主为管胞，通常无导管，但麻黄茎的构造与双子叶植物草质茎类同。
2. 粉末特征
除了无叶肉组织外，其它组织一般都可能存在。
四.皮类药材
1. 组织构造
皮类药材是木本植物形成层以外的部分，通常包括木栓组织、皮层及韧皮部。观察木栓组织应注意木栓细胞的层数、颜色、细胞壁的增厚程度等。皮层一般较狭窄，通常是由栓内层形成的次生皮层。韧皮部占皮的绝大部分，应注意韧皮射线的宽度 ( 细胞列数 ) 、射线细胞的形状、壁厚度、纹孔、内含物等。韧皮部及皮层往往有厚壁组织（纤维或石细胞）存在；有的皮类药材的韧皮部中，纤维或石细胞切向集结成若干层带 ( 硬韧部 ) ，与筛管群、薄壁组织 ( 软韧部 ) 相间排列。
皮类药材常有树脂道、油细胞、乳汁管等分泌组织以及草酸钙结晶。多数皮类药材含淀粉粒，但较微小。
2. 粉末特征
主要有木栓细胞、纤维、石细胞、分泌组织及草酸钙结晶等。筛管分子端壁复筛板的筛域常可察见，松科植物筛胞侧壁上的筛域亦易见。一般不应有木质部的组织，如导管、管胞等。
五.木类药材
木类药材指木本植物树干、根形成层以内的所有组织，即主要为次生木质部木材。药用一般为心材。次生木质部的主要组成有轴向系统的导管、管胞、纤维、木薄壁细胞及径向系统的射线薄壁细胞。
1. 组织构造
木类药材通常从三个切面观察组织构造。横切面主要观察木射线宽度 ( 细胞列数 ) 、密度，导管与木薄壁细胞的比例及分布型式，导管和木纤维的形状、直径等；切向纵切面主要观察木射线的宽度、高度及类型，木射线在切向纵切面呈梭形，其宽度是指*宽处的细胞数，高度是指从上至下的细胞数，同时观察导管、木纤维等；径向纵切面主要观察木射线的高度及细胞类型 ( 同型细胞射线或异型细胞射线 ) ，木射线在径向纵切面呈横带状，与轴向的导管、木纤维、木薄壁细胞相垂直，同时观察导管的类型，导管分子的长短、直径及有无侵填体，木纤维的类型及大小、壁厚度、纹孔等。
2. 粉末特征
以导管、木纤维、木薄壁细胞、木射线细胞的形态特征，以及细胞后含物为主要鉴别点。
六.叶类药材
1. 组织构造
通常作横切片观察表皮、叶肉及叶脉的组织构造，要注意上、下表皮细胞的形状、大小、外壁、气孔、角质层厚度，以及有无内含物，特别是毛茸的类型及其特征。
2. 叶的表面制片
主要观察表皮细胞、气孔及各种毛茸的全形，以及叶肉组织的某些鉴别点，如草酸钙结晶类型及其分布等。应注意上、下表皮细胞的形状，垂周壁，角质层纹理，气孔的型式。毛茸为叶类药材的重要鉴别特征，应注意观察非腺毛、腺毛的细胞形状、细胞壁的厚度及其表面特征。
另外，观察叶的表面制片，可用以测定栅表细胞比、气孔数、气孔指数及脉岛数，对鉴别亲缘相近的同属植物的叶，有一定参考意义。
3. 粉末特征
与叶的表面制片基本一致，但毛茸多碎断，粉末中还可见到叶片的横断面及晶体。
七.花类药材
1. 花类药材的显微鉴定
根据不同的目的物，将苞片、花萼、花冠、雄蕊或雌蕊等分别作表面制片，或将完整的花作表面制片观察。苞片、花萼的构造，与叶相似。花粉粒为花类药材的重要特征，应注意其形状、大小、萌发孔状况、外壁雕纹等。
八.果实类药材
1.组织构造
一般观察果皮的组织特征。由子房壁分化和增大形成的真果的果皮，可分为外果皮、中果皮及内果皮，内、外果皮相当于叶的上、下表皮，中果皮相当于叶肉。
外果皮为 1 列表皮细胞，观察注意点同叶。中果皮为多列薄壁细胞，有细小维管束散布；中果皮中常有分泌组织及厚壁组织分布。内果皮的变异较大，有的为 1 列薄壁细胞，有的散在石细胞或结晶细胞层等。
2. 粉末特征
观察外果皮应注意细胞的形状、垂周壁的增厚状况、角质层纹理以及非腺毛、腺毛的有无及其特征；中果皮应注意分泌组织、厚壁组织及结晶的特征；内果皮注意细胞的形态与类型。对含有种子的果实类药材，还应注意种皮、胚乳组织等特征。
九.种子类药材
1. 组织构造
着重观察种皮的构造。有的种皮只有 1 列细胞，较多的种皮由数种不同的细胞组织构成。
种子的外胚乳、内胚乳或子叶细胞的形状、细胞壁增厚状况，以及所含脂肪油、糊粉粒或淀粉粒等，也有鉴别意义。
2. 粉末特征
注意种皮的表面观及断面观形态特征。其次应注意种皮支持细胞、油细胞、色素细胞的有无和形态；有无毛茸、草酸钙结晶、淀粉粒、分泌组织碎片等。
十.全草类药材
大多为草本植物的地上部分，少数为带根的全株。全草类包括了草本植物药的各个部位，其显微鉴定可参照以上各类药材的鉴别特征。
十一.菌类药材
大多以子实体或菌核的形式入药，无淀粉粒和高等植物的显微特征。观察时应注意菌丝的形状、有无分枝、颜色、大小；团块、孢子的形态；结晶的有无及形态、大小与类型。
十二.动物类药材
因药用部位不同，有动物体、分泌物、病理产物和角甲类之分。
动物全体应注意皮肤碎片细胞的形状与色素颗粒的颜色，肌纤维的形态，刚毛的形态、大小及颜色，体壁碎片颜色、表面纹理及菌丝体，骨碎片，骨陷窝的形态等。带有鳞片的动物体还应注意鳞片角质增厚特征。
分泌物和病理产物应注意团块的颜色及其包埋物的性质特征，表皮脱落组织，毛茸及其它细胞的形状、大小、颜色等特征。
角甲类药材应注意碎块的形状、颜色、横断面和纵断面观的形态特征及色素颗粒颜色等。
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